gentoo-mirror/gentoo
1
0
Fork 0
mirror of https://github.com/gentoo-mirror/gentoo.git synced 2026-01-06 02:17:34 -08:00
Code Issues Projects Releases Wiki Activity
gentoo/sci-biology
History
Alfred Wingate 08ee8c9738
sci-biology/newick-utils: add dev-libs/libxml2 subslot op for incoming ABI break 
Signed-off-by: Alfred Wingate <parona@protonmail.com>
Part-of: https://github.com/gentoo/gentoo/pull/41919
Signed-off-by: Sam James <sam@gentoo.org>
2025-06-09 04:11:17 +01:00
..
aaindex
…
abyss
…
amap
…
augustus
sci-biology/augustus: drop 2.5.5
2025-05-20 21:12:22 +02:00
bamtools
sci-biology/bamtools: drop 2.5.2, 2.5.2-r1
2025-05-21 21:20:54 +02:00
bcftools
sci-biology/bcftools: add 1.21
2025-03-21 15:58:59 +01:00
bedtools
sci-biology/bedtools: drop 2.30.0
2025-04-29 20:37:58 +01:00
bfast
sci-biology/bfast: drop 0.7.0a
2025-04-09 20:31:40 +03:00
biogrep
…
bioperl
…
bioperl-db
…
bioperl-network
…
bioperl-run
…
biopython
sci-biology/biopython: remove unused patch(es)
2025-05-27 09:27:36 +01:00
biosql
…
blat
…
bowtie
sci-biology/bowtie: Remove old
2025-05-01 13:36:04 +02:00
bwa
sci-biology/bwa: note that filter-lto has been fixed upstream
2025-03-25 00:11:07 -04:00
cd-hit
…
clustal-omega
…
clustalw
…
clustalw-mpi
…
cutg
…
dialign2
…
dialign-tx
…
elph
…
embassy
…
embassy-cbstools
…
embassy-clustalomega
…
embassy-domainatrix
…
embassy-domalign
…
embassy-domsearch
…
embassy-emnu
…
embassy-esim4
…
embassy-hmmer
…
embassy-iprscan
…
embassy-mse
…
embassy-phylipnew
…
embassy-signature
…
embassy-structure
…
embassy-topo
…
embassy-vienna
…
emboss
…
eugene
…
exonerate
…
fasta
sci-biology/fasta: implicit declaration of function ftello
2025-04-17 12:02:23 +02:00
fasttree
sci-biology/fasttree: add github upstream metadata
2025-05-22 02:02:12 +01:00
fastx_toolkit
…
finchtv
…
foldingathome
…
glimmer
…
glimmerhmm
…
gmap
…
hmmer
…
iedera
…
infernal
…
iqpnni
…
kalign
…
kallisto
…
lagan
…
libgtextutils
…
mafft
…
maq
…
maqview
…
mcl
…
mosaik
…
mothur
…
mrbayes
…
mummer
…
muscle
…
newick-utils
sci-biology/newick-utils: add dev-libs/libxml2 subslot op for incoming ABI break
2025-06-09 04:11:17 +01:00
pals
…
paml
…
phylip
…
phyml
…
piler
…
pilercr
…
plink
…
poa
…
prank
…
primer3
…
prints
…
probcons
…
prodigal
…
profphd
…
prosite
…
pysam
sci-biology/pysam: Remove old
2025-03-22 21:06:33 +01:00
qrna
…
raxml
…
rebase
…
recon
…
rnaview
…
samtools
sci-biology/samtools: Stabilize 1.20 amd64, #920140
2025-04-14 16:57:56 +01:00
seaview
…
seqan
…
sibsim4
…
sim4
…
STAR
…
stride
…
t-coffee
…
tree-puzzle
…
treeviewx
sci-biology/treeviewx: slot op on x11-libs/wxGTK
2025-05-17 16:57:29 +02:00
trf
…
trnascan-se
…
uchime
…
ucsc-genome-browser
…
unafold
…
update-blastdb
…
vcftools
…
velvet
…
wise
…
yass
sci-biology/yass: Fix build with USE=lowmem
2025-02-24 21:25:54 +00:00
metadata.xml
…