gentoo-mirror/gentoo
1
0
Fork 0
mirror of https://github.com/gentoo-mirror/gentoo.git synced 2026-11-08 18:27:07 -08:00
Code Issues Projects Releases Wiki Activity
Files
c19e32e0d1098f610fb3e738e4e3ff9cba81dfd9
gentoo/sci-biology
T
History
Andrew Ammerlaan ad0f0da9f1 sci-biology/bowtie: add 2.5.1 
Signed-off-by: Andrew Ammerlaan <andrewammerlaan@gentoo.org>
2023-02-24 08:29:55 +01:00
..
aaindex
…
abyss
…
amap
…
augustus
sci-biology/augustus: move remote-id inside upstream block
2023-02-06 17:43:55 +00:00
bamtools
…
bcftools
sci-biology/bcftools: drop 1.15.1
2023-02-19 16:44:20 +01:00
bedtools
*/*: remove py3.8 from PYTHON_COMPAT
2023-01-14 13:51:19 +01:00
bfast
…
biogrep
…
biopandas
sci-biology/biopandas: add 0.4.1
2023-02-24 08:00:10 +01:00
bioperl
…
bioperl-db
…
bioperl-network
…
bioperl-run
…
biopython
sci-biology/biopython: add 1.81
2023-02-24 08:10:27 +01:00
biosql
…
blat
…
bowtie
sci-biology/bowtie: add 2.5.1
2023-02-24 08:29:55 +01:00
bwa
…
cd-hit
…
clustal-omega
…
clustalw
…
clustalw-mpi
…
clustalx
…
cutg
…
dialign2
…
dialign-tx
…
elph
…
embassy
…
embassy-cbstools
…
embassy-clustalomega
…
embassy-domainatrix
…
embassy-domalign
…
embassy-domsearch
…
embassy-emnu
…
embassy-esim4
…
embassy-hmmer
…
embassy-iprscan
…
embassy-mse
…
embassy-phylipnew
…
embassy-signature
…
embassy-structure
…
embassy-topo
…
embassy-vienna
…
emboss
…
eugene
sci-biology/eugene: fix clang 16 build
2022-10-23 20:18:05 +01:00
exonerate
…
express
…
fasta
…
fasttree
…
fastx_toolkit
…
finchtv
…
foldingathome
…
glimmer
…
glimmerhmm
…
gmap
…
hmmer
sci-biology/hmmer: expose XSI pthread_setconcurrency() prototypes
2022-11-20 22:23:10 +01:00
HTSeq
sci-biology/HTSeq: enable py3.11
2023-02-24 08:00:09 +01:00
iedera
…
infernal
…
iqpnni
…
kalign
…
kallisto
…
lagan
…
libgtextutils
…
mafft
…
maq
…
maqview
…
mcl
…
mosaik
…
mothur
…
mrbayes
…
mummer
…
muscle
…
newick-utils
…
pals
…
paml
…
phylip
…
phyml
…
piler
…
pilercr
…
plink
…
poa
sci-biology/poa: fix clang 16 build
2022-10-23 20:18:06 +01:00
prank
…
primer3
…
prints
…
probcons
…
prodigal
…
profphd
…
prosite
…
pysam
sci-biology/pysam: drop 0.19.1
2023-02-19 16:44:18 +01:00
qrna
…
raxml
…
rebase
…
recon
…
rnaview
…
samtools
sci-biology/samtools: drop 1.15.1
2023-02-19 16:44:19 +01:00
seaview
…
seqan
sci-biology/seqan: drop 2.4.0-r1
2022-12-19 15:44:57 +01:00
sibsim4
…
sim4
…
STAR
…
stride
…
t-coffee
…
tree-puzzle
sci-biology/tree-puzzle: regenerate configure script for clang 16
2022-11-19 05:45:55 +01:00
treeviewx
…
trf
…
trnascan-se
sci-biology/trnascan-se: fix build w/ clang16, pass -std=gnu89
2022-10-19 05:21:44 -04:00
uchime
sci-biology/uchime: align longdescription opening and closing tags
2022-10-20 04:52:28 +01:00
ucsc-genome-browser
…
unafold
sci-biology/unafold: fix clang 16 build
2022-10-23 20:18:07 +01:00
update-blastdb
…
vcftools
…
velvet
…
wise
…
yass
…
metadata.xml
…