David Seifert bb22a23b26 sci-biology/mafft: add 7.525 ...

Closes: https://bugs.gentoo.org/944919
Signed-off-by: David Seifert <soap@gentoo.org>

2025-11-09 11:55:17 +01:00

..

aaindex

…

abyss

…

amap

…

augustus

*/*: Add := to virtual/zlib deps, part 1

2025-11-04 10:36:27 +01:00

bamtools

sci-*/*: update for virtual/zlib

2025-11-04 09:17:06 +01:00

bcftools

*/*: Add := to virtual/zlib deps, part 1

2025-11-04 10:36:27 +01:00

bedtools

*/*: Use := on virtual/zlib deps, part 6

2025-11-04 11:08:49 +01:00

bfast

…

biogrep

…

bioperl

…

bioperl-db

…

bioperl-network

…

bioperl-run

…

biopython

…

biosql

…

blat

…

bowtie

*/*: Add := to virtual/zlib deps, part 1

2025-11-04 10:36:27 +01:00

bwa

*/*: Use := on virtual/zlib deps, part 6

2025-11-04 11:08:49 +01:00

cd-hit

…

clustal-omega

…

clustalw

…

clustalw-mpi

…

cutg

…

dialign2

…

dialign-tx

…

elph

…

embassy

…

embassy-cbstools

…

embassy-clustalomega

…

embassy-domainatrix

…

embassy-domalign

…

embassy-domsearch

…

embassy-emnu

…

embassy-esim4

…

embassy-hmmer

…

embassy-iprscan

…

embassy-mse

…

embassy-phylipnew

…

embassy-signature

…

embassy-structure

…

embassy-topo

…

embassy-vienna

…

emboss

…

eugene

…

exonerate

…

fasta

…

fasttree

…

fastx_toolkit

…

finchtv

…

foldingathome

*/*: Add := to virtual/zlib deps, part 1

2025-11-04 10:36:27 +01:00

glimmer

…

glimmerhmm

…

gmap

…

hmmer

…

iedera

…

infernal

…

iqpnni

…

kalign

…

kallisto

sci-*/*: update for virtual/zlib

2025-11-04 09:17:06 +01:00

lagan

…

libgtextutils

…

mafft

sci-biology/mafft: add 7.525

2025-11-09 11:55:17 +01:00

maq

*/*: Use := on virtual/zlib deps, part 6

2025-11-04 11:08:49 +01:00

maqview

*/*: Use := on virtual/zlib deps, part 6

2025-11-04 11:08:49 +01:00

mcl

…

mosaik

…

mothur

…

mrbayes

…

mummer

…

muscle

…

newick-utils

…

pals

…

paml

…

phylip

…

phyml

…

piler

…

pilercr

…

plink

*/*: Add := to virtual/zlib deps, part 1

2025-11-04 10:36:27 +01:00

poa

…

prank

…

primer3

…

prints

…

probcons

…

prodigal

…

profphd

…

prosite

…

pysam

…

qrna

…

raxml

…

rebase

…

recon

…

rnaview

…

samtools

*/*: Use := on virtual/zlib deps, part 6

2025-11-04 11:08:49 +01:00

seaview

*/*: Add := to virtual/zlib deps, part 1

2025-11-04 10:36:27 +01:00

seqan

sci-*/*: update for virtual/zlib

2025-11-04 09:17:06 +01:00

sibsim4

…

sim4

…

STAR

…

stride

…

t-coffee

…

tree-puzzle

…

treeviewx

…

trf

…

trnascan-se

…

uchime

sci-biology/uchime: Fix build w/ cmake-4

2025-10-05 19:44:06 +02:00

ucsc-genome-browser

…

unafold

…

update-blastdb

…

vcftools

*/*: Add := to virtual/zlib deps, part 1

2025-11-04 10:36:27 +01:00

velvet

…

wise

…

yass

…

metadata.xml

…