gentoo-mirror/gentoo
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mirror of https://github.com/gentoo-mirror/gentoo.git synced 2026-01-06 02:17:34 -08:00
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gentoo/sci-biology
History
Alexey Shvetsov 1052e61ab9
sci-biology/biopython: add 1.85, drop 1.81-r1 
Closes: https://bugs.gentoo.org/952648
Signed-off-by: Alexey Shvetsov <alexxy@gentoo.org>
2025-04-03 21:02:14 +03:00
..
aaindex
…
abyss
…
amap
…
augustus
sci-biology/augustus: fix gcc15 build
2025-02-13 08:45:32 +00:00
bamtools
…
bcftools
sci-biology/bcftools: add 1.21
2025-03-21 15:58:59 +01:00
bedtools
…
bfast
…
biogrep
…
bioperl
…
bioperl-db
…
bioperl-network
…
bioperl-run
…
biopython
sci-biology/biopython: add 1.85, drop 1.81-r1
2025-04-03 21:02:14 +03:00
biosql
…
blat
…
bowtie
…
bwa
sci-biology/bwa: note that filter-lto has been fixed upstream
2025-03-25 00:11:07 -04:00
cd-hit
…
clustal-omega
…
clustalw
…
clustalw-mpi
…
clustalx
…
cutg
…
dialign2
…
dialign-tx
…
elph
…
embassy
…
embassy-cbstools
…
embassy-clustalomega
…
embassy-domainatrix
…
embassy-domalign
…
embassy-domsearch
…
embassy-emnu
…
embassy-esim4
…
embassy-hmmer
…
embassy-iprscan
…
embassy-mse
…
embassy-phylipnew
…
embassy-signature
…
embassy-structure
…
embassy-topo
…
embassy-vienna
…
emboss
…
eugene
…
exonerate
…
fasta
…
fasttree
…
fastx_toolkit
…
finchtv
…
foldingathome
…
glimmer
…
glimmerhmm
…
gmap
…
hmmer
…
iedera
…
infernal
…
iqpnni
…
kalign
…
kallisto
…
lagan
…
libgtextutils
…
mafft
…
maq
…
maqview
…
mcl
…
mosaik
…
mothur
…
mrbayes
…
mummer
…
muscle
sci-biology/muscle: Stabilize 5.1.0 amd64, #945576
2024-12-05 18:30:08 +00:00
newick-utils
…
pals
…
paml
…
phylip
…
phyml
…
piler
…
pilercr
…
plink
…
poa
…
prank
…
primer3
…
prints
…
probcons
…
prodigal
…
profphd
…
prosite
…
pysam
sci-biology/pysam: Remove old
2025-03-22 21:06:33 +01:00
qrna
…
raxml
…
rebase
…
recon
…
rnaview
…
samtools
sci-biology/samtools: add 1.21
2025-03-21 15:59:00 +01:00
seaview
sci-biology/seaview: add binding := to fltk, soname changed
2024-12-26 12:48:34 -05:00
seqan
…
sibsim4
…
sim4
…
STAR
…
stride
…
t-coffee
…
tree-puzzle
…
treeviewx
…
trf
…
trnascan-se
…
uchime
…
ucsc-genome-browser
…
unafold
…
update-blastdb
…
vcftools
…
velvet
Move {sys-devel → llvm-core}/clang-runtime
2024-12-11 12:53:16 +01:00
wise
…
yass
sci-biology/yass: Fix build with USE=lowmem
2025-02-24 21:25:54 +00:00
metadata.xml
…