gentoo-mirror/gentoo
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gentoo/sci-biology
History
Sergei Trofimovich caf207dd9d sci-biology/abyss: disable CFLAGS QA check on samtobreak 
GHC uses it's own native code generator. Portage's
QA check generates false positive because it assumes
presence of GCC-specific sections.

Workaround false positiove by disabling the check, bug #677600.

Bug: https://bugs.gentoo.org/677600
Package-Manager: Portage-2.3.100, Repoman-2.3.22
Signed-off-by: Sergei Trofimovich <slyfox@gentoo.org>
2020-05-25 11:55:52 +01:00
..
aaindex
…
abyss
sci-biology/abyss: disable CFLAGS QA check on samtobreak
2020-05-25 11:55:52 +01:00
amap
…
amos
…
ApE
…
augustus
…
bamtools
sci-biology/bamtools: remove inactive maintainer
2020-04-14 11:34:31 +03:00
bcftools
sci-biology/bcftools: remove inactive maintainer
2020-04-14 11:34:31 +03:00
bedtools
sci-biology/bedtools: remove inactive maintainer & long desc.
2020-04-14 11:34:31 +03:00
bfast
…
biogrep
…
biopandas
sci-biology/biopandas: Remove Python 2
2020-01-16 06:16:48 +01:00
bioperl
…
bioperl-db
…
bioperl-network
…
bioperl-run
…
biopython
*/*: Clean PYTHON_COMPAT of obsolete impls
2020-01-05 11:55:46 +01:00
biosql
…
blat
…
bowtie
…
bwa
sci-biology/bwa: Fix -fno-common bug
2020-01-25 20:38:35 +01:00
cd-hit
…
clustal-omega
…
clustalw
sci-biology/clustalw: Drop alpha keywords
2020-03-15 23:30:12 -07:00
clustalw-mpi
…
clustalx
sci-biology/clustalx: EAPI-7 bump, update HOMEPAGE
2020-05-21 21:42:19 +02:00
consed
…
cutg
…
dialign2
…
dialign-tx
…
diya
…
elph
…
embassy
…
embassy-cbstools
…
embassy-clustalomega
…
embassy-domainatrix
…
embassy-domalign
…
embassy-domsearch
…
embassy-emnu
…
embassy-esim4
…
embassy-hmmer
…
embassy-iprscan
…
embassy-meme
…
embassy-mse
…
embassy-phylipnew
sci-biology/embassy-phylipnew: Change LICENSE to "free-noncomm".
2019-12-28 14:56:19 +01:00
embassy-signature
…
embassy-structure
…
embassy-topo
…
embassy-vienna
…
emboss
…
eugene
…
exonerate
…
express
…
fasta
…
fasttree
…
fastx_toolkit
…
finchtv
…
foldingathome
sci-biology/foldingathome: bump to 7.6.13
2020-05-14 10:59:03 -04:00
gatk
…
GBrowse
…
gibbs
…
glimmer
…
glimmerhmm
…
gmap
…
hmmer
…
HTSeq
sci-biology/HTSeq: remove inactive maintainer
2020-04-14 11:34:31 +03:00
iedera
…
infernal
…
iqpnni
…
kalign
…
kallisto
sci-biology/kallisto: drop inactive maintainer
2020-04-14 11:34:32 +03:00
lagan
…
last
…
libgtextutils
…
mafft
sci-biology/mafft: Remove old
2020-04-22 11:29:43 +02:00
maq
…
maqview
…
mcl
…
meme
…
mira
…
mosaik
…
mothur
…
mrbayes
…
mummer
…
muscle
…
ncbi-tools
…
newick-utils
…
njplot
…
pals
…
paml
…
phrap
…
phred
…
phylip
…
phyml
…
picard
…
piler
…
pilercr
…
plink
…
poa
sci-biology/poa: [QA] inherit toolchain-funcs.eclass directly
2020-02-13 22:37:57 +01:00
prank
…
primer3
…
prints
…
probcons
…
prodigal
…
profphd
…
prosite
…
psipred
…
pysam
sci-biology/pysam: Remove py2
2020-02-11 13:17:22 +01:00
qrna
sci-biology/qrna: Port to EAPI 7
2020-02-23 12:51:59 +01:00
raxml
…
rebase
…
recon
…
repeatmasker
…
repeatmasker-libraries
…
rmblast
…
rnaview
…
samtools
sci-biology/samtools: Remove python dependency
2020-03-27 11:35:24 +01:00
seaview
…
seqan
…
shrimp
…
sibsim4
…
sim4
…
STAR
sci-biology/STAR: remove inactive maintainer
2020-04-14 11:34:32 +03:00
stride
…
t-coffee
…
transfac
…
tree-puzzle
…
treeviewx
…
trf
…
trnascan-se
…
uchime
…
ucsc-genome-browser
…
unafold
…
update-blastdb
…
vcftools
…
velvet
…
vienna-rna
…
wgs-assembler
…
wise
…
yass
…
metadata.xml
…