Sam James 1286481b0c sci-biology/glimmerhmm: update EAPI 7 -> 8 ...

Signed-off-by: Sam James <sam@gentoo.org>

2024-03-12 06:22:02 +00:00

..

aaindex

…

abyss

sci-biology/abyss: mark as LTO-unsafe

2024-03-08 11:09:00 +00:00

amap

…

augustus

…

bamtools

…

bcftools

…

bedtools

…

bfast

…

biogrep

…

biopandas

…

bioperl

…

bioperl-db

…

bioperl-network

…

bioperl-run

…

biopython

sci-biology/biopython: sys-devel/flex -> app-alternatives/lex

2024-01-08 12:02:22 +00:00

biosql

…

blat

…

bowtie

…

bwa

sci-biology/bwa: mark as LTO-unsafe

2024-02-29 04:47:16 +00:00

cd-hit

…

clustal-omega

…

clustalw

…

clustalw-mpi

…

clustalx

…

cutg

…

dialign2

…

dialign-tx

…

elph

…

embassy

…

embassy-cbstools

…

embassy-clustalomega

…

embassy-domainatrix

…

embassy-domalign

…

embassy-domsearch

…

embassy-emnu

…

embassy-esim4

…

embassy-hmmer

…

embassy-iprscan

…

embassy-mse

…

embassy-phylipnew

…

embassy-signature

…

embassy-structure

…

embassy-topo

…

embassy-vienna

…

emboss

Move {sys-devel → dev-build}/cons

2024-01-17 18:14:48 +01:00

eugene

…

exonerate

sci-biology/exonerate: mark LTO-unsafe

2024-02-29 02:18:39 +00:00

fasta

…

fasttree

…

fastx_toolkit

…

finchtv

…

foldingathome

…

glimmer

…

glimmerhmm

sci-biology/glimmerhmm: update EAPI 7 -> 8

2024-03-12 06:22:02 +00:00

gmap

…

hmmer

…

HTSeq

…

iedera

…

infernal

…

iqpnni

…

kalign

…

kallisto

…

lagan

…

libgtextutils

…

mafft

…

maq

…

maqview

…

mcl

…

mosaik

…

mothur

…

mrbayes

…

mummer

…

muscle

…

newick-utils

…

pals

…

paml

…

phylip

…

phyml

…

piler

…

pilercr

sci-biology/pilercr: Stabilize 1.0-r3 amd64, #920144

2023-12-16 18:17:08 +02:00

plink

…

poa

…

prank

…

primer3

…

prints

…

probcons

…

prodigal

…

profphd

…

prosite

…

pysam

…

qrna

…

raxml

…

rebase

…

recon

…

rnaview

…

samtools

…

seaview

…

seqan

…

sibsim4

…

sim4

…

STAR

…

stride

…

t-coffee

…

tree-puzzle

…

treeviewx

…

trf

…

trnascan-se

…

uchime

…

ucsc-genome-browser

…

unafold

Move {sys-devel → dev-build}/autoconf-archive

2024-01-15 16:58:23 +01:00

update-blastdb

…

vcftools

…

velvet

…

wise

…

yass

…

metadata.xml

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